东北湖区的湖泊，鱼类区系比较复杂，呈现出南北交替的特色。
既有印度平原复合体的黄鳢鱼和乌鳢鱼、又有中国平原复合体的鲤、鲫、鲉、鳊、草及鲢鱼等鱼类；既有北方复合体的哲罗鱼和细鳞鱼，还有北极淡水复合体的红点鲑及江鳕鱼等等。
其中兴凯青梢红鲐，是我国「四大名鱼」之一，镜泊湖所产的银鲫，个体大，素有「湖鲫」之称而名闻全国。
根据二十世纪70年代资料的统计，五大连池鱼类亩产在15kg左右，镜泊湖亩产近6.5kg,小兴凯湖为1.3kg。
东北拥有黑龙江、辽河、松花江、嫩江和乌苏里江等七大河流，这些大河流域的湖泊，是天然的淡水鱼类之乡，这些湖泊自然环境极其优越，水质纯净，鱼类生长的条件有利，因此每年都有丰富的水产品出产，是东北人吃鱼的首选之地。
此外，东北还有诸如查干湖等众多自然湖泊，湖中有各种珍贵的淡水鱼，其中最具代表性的品种是胖头鱼。查干湖冬捕胖头鱼已成为了东北的一大特色，
