卸任西安交通大學校長不到一周時間，王樹國校長就有了新職務，繼續擔任大學校長，接替梅宏院士，成為福耀科技大學校長，引起了一片熱議，很多人拍手叫好，認為曹德旺先生有眼光，慧眼識珠，二人牽手可謂是眾望所歸，可是同時也引發了一些爭議，其中最大爭議就是福耀科技大學頻繁換帥，3年換了3位校長！
福耀科技大學是一所由曹德旺先生捐資100億籌建的一所民辦高校，位於福建省福州市高新區沖南岩鎮流洲島，緊鄰福州大學城和海西高新技術產業園，占地1200多畝，與其他民辦高校一樣，實行董事會或者理事會負責制，其定位是高水平理工科研究型國際化大學，培養國內新興產業急需的研究型，復合型實用型人才，相比大部份民辦高校，福耀科技大學起點比較高，直接就是本科學歷和研究生學歷，只是稍微比施一公創辦的西湖大學低一點，算得上是民辦高校界一顆冉冉升起的新星。
可是在福耀科技大學還未正式開始招生前就開始頻繁換校長，3年換了3位校長，第一任校長是原廈門大學校長朱崇實，他在廈大擔任了14年校長，主要從事經濟法學方面的研究，結果任職福耀科技大學校長一年多就辭職了，他在任期間福耀科技大學還在籌建工作進展中，算是也完成了任期內的主要工作。
福耀科技大學第一次換校長後，迎來一位院士校長，中國科學院院士梅宏成為新校長，一下子引起了不少人的註意，要知道民辦高校裏院士當校長的屈指可數，配置一下子與西湖大學看齊，都由院士當校長，絕對算得上高配置，而且梅宏院士從事軟體工程和系統軟體領域的研究，與福耀科技大學的辦學定位很搭，並且還曾擔任過北京理工大學、上海交通大學擔任副校長，可是就這樣一位校長結果任職半年多就被換了，然後由王樹國校長擔任新校長，因此很多人質疑頻繁換帥並不是好事，那麽問題就來了民辦高校該由誰說了算？
答案顯而易見，董事會說了算，學校到底怎麽辦、請誰來管理、有多大的資金投入取決於實控人，估計看到這裏，福耀科技大學頻繁換帥也就不足為奇了，因為這就是民辦大學和公辦大學的最大區別，民辦大學校長需要與舉辦者在辦學定位、理念和方法上高度一致，王樹國曾評價福耀科技大學：培養套用型人才，符合社會需求。王校長評價非常契合該所民辦大學的理念，當然不能說前兩任校長不優秀，可能是誰最合適才是最重要的。
