客家人是指分布在我国南方各省的讲客家话的一个汉族民系，大约有6562万人口。在各国的华侨中也有很大比例的客家人。闽、粤、赣交界地区是客家人最集中的地区。尤其是我国广东梅州、福建长汀和江西赣州等地是客家人最出名的聚集地和出发地。
三四十年代针对当时存在的某些「客家非汉族论」、「客家为汉族与苗、瑶、僮、畲等族的混血种说」，罗香林把客家人讲成是「中原最纯正的正统汉人的后裔」。实际上， 这两种理论都只对了一部分，古籍的记载和基因的研究正好对应一下。
Y染色体单倍群研究父系起源
随着分子遗传学的发展，利用基因技术研究客家人的起源，终于解开客家人身上的层层迷雾。Y染色体DNA单倍型类群是利用Y染色体遗传变异特性进行人类学研究的一门科学，研究父系血统的演变。
复旦大学生命科学学院李辉教授 等通过Y染色体单核苷酸突变（Y-SNP）检测研究分析了 福建长汀 148名客家男性的Y染色体标记。这148人包括47个姓氏，彼此没有亲缘关系，应该代表了绝大部分长汀客家人。
畲族服饰
研究发现客家人在遗传群聚上与北方汉族紧密相关，并且与畲族和苗瑶壮侗语族人群也有密切联系。混合分析显示， 客家人的基因库主要来自北方汉族，占80.2% ， 畲族是所有非汉族群体中贡献最大的，13%来自畲族 ，6.8%来自侗族。这正好印证了史书上记载的， 客家先民就是从中原南迁的汉人 ，但在迁徙和发展时混入了南方瑶族、畲族、侗族等少数民族母系血统。
线粒体DNA研究母系起源
人类线粒体基因组COⅡ 和t RN Al ys 基因间的一小段非编码序列（region V）通常含有2个串联重复的9b p 序列( CC C C C TC T A ), 其中的一个重复序列在DNA 复制过程中可能由于滑链错配。W rischnik等最早运用这一多态标记于人群研究中，发现该区域串联重复发生缺失的频率具有人群中分布的特征性，是一个研究人类群体遗传学的较好标记。
李辉教授的研究发现，长汀客家人的线粒体Region V 区段的检测发现有19.7%左右的9bp 缺失（单拷贝）个体。中国9bp缺失的比例在苗瑶语群体中最高。特别是湖南广西之间高达30%～50%，而中原汉族则维持在10%上下。畲族的比例为15%。客家人与畲族没有显著差异而明显高于中原汉族。
中山大学蔡贵庆教授 对梅州客家人69份样本检测发现，广东梅州地区客家人与福建长汀客家人的遗传背景非常近似，提示两个人群可能是同一母系来源。
从分子遗传学上推测福建客家的迁徙路线
从Y-SNP 数据看，福建长汀客家人中大多数男性可能来源于中原汉族。客家祖先应当是通过湖北、江西进入闽西的。在通过湖北时融入了部分当地荆蛮土著，通过江西地区时融入了干越。侗族是干越的后裔。所以客家人中6.8%的与侗族相似的结构，也很可能来自其迁徙路线上江西的古代干越族。
畲族的族源主要有外来说和本地说两种：外来说源自长沙「武陵蛮」；本地说主张畲族是古代「越族」之后裔。在学术界已经取得共识的是：至迟在隋唐时代，畲族先民已经居住在今闽、粤、赣三省交界地区。对于福建越族土著和先到汉民而言，畲族同客家人一样是「客」。从线粒体DNA的研究看，母系血统比父系血统的交流频繁得多。畲族和客家人这两个群体之间的通婚曾普遍发生。
参考文献：
1.李辉，潘悟云，文波等.客家人起源的遗传学分析，【遗传学报】，2003，30（9）
2.蔡贵庆,朱伟锋 , 伍新尧等。广东梅州客家人起源的线粒体遗传学分析，【中山大学学报·医学科学版】2005．0192
3.姚永刚等,中国民族人群线粒体DNA 9bp 序列缺失的分布,【自然科学进展】2001 年 4月
