辣椒早疫病和晚疫病的病原不同：辣椒早疫病病原为茄链格孢，又称轮纹病，属于真菌性病害，。辣椒晚疫病病原为辣椒疫霉菌。
辣椒早疫病和晚疫病的区别
苗期发病的特征不同;
辣椒早疫病多在辣椒幼苗3-5叶期发生，导致叶尖和顶芽腐烂，形成无顶苗。
辣椒晚疫病表现为茎基部呈暗绿色水浸状软腐或者猝倒，因此又被称为 苗期猝倒病 。
成株期发病的特征不同;
辣椒早疫病的叶片受害后，在发病初期呈水渍暗褐色的小斑点，随后扩大呈圆形或椭圆形;而茎部被害后呈灰褐色的椭圆形，稍凹陷。
辣椒晚疫病的叶片染病后会出现污褐色且边缘不明显的病斑，而病叶会很快湿腐脱落;茎 染病后，在发病初期，有水浸状的斑，病情扩展后就会变成「黑杆」。
辣椒早疫病和晚疫病的防治
防治辣椒早疫病的方法:
选用抗病品种并在地势高、向阳的田块种植，方便雨季排水。平时注意田间的通风，降低温湿度，发现病叶后需要及时带出田外深埋。种子消毒可用50%多菌灵500-600倍液浸种20分钟，随后用清水冲洗干净后，再晾干播 种。
喷药防治可用72%锰锌霜脲可湿性粉剂600倍液、72%克抗灵可湿性粉剂600倍液等药剂防治，每隔7-10天喷1次，连续防治2-3次。
防治辣椒晚疫病的方法:
实行轮作，增施有机肥料、磷钾肥和微肥，适量施用氮肥，改善土壤结构。在管理时，需尽量减少人为机械创伤，避免造成伤口，若茎干发病，可用200倍70%代森锰锌药液涂抹病斑。
可用25%甲霜灵可湿性粉剂700倍液对病穴以及周围植株进行灌根，每株药液量为250g，灌1-2次，间隔期为5-7天。可在发病初期用72%克露可湿性粉剂500倍液防治。
