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復現一篇8.7分的cis-pQTL聯合單細胞分析SCI論文
8.7分SCI論文復現記：我的硬碟哭暈在廁所
各位看官，且聽我細細道來！最近我盯上了一篇8.7分的SCI論文，主題是cis-pQTL聯合單細胞分析，聽起來就高大上，感覺自己瞬間擁有了諾貝爾獎提名者的氣質（此處應有掌聲）。然而，當我興沖沖準備復現這篇文章時，現實給了我當頭一棒——我的硬碟哭暈在廁所了！
這篇文章的核心思路，簡單來說就是用冰島人的基因數據（pQTL）和單細胞數據，尋找疾病相關的基因。聽起來是不是很簡單？但實際操作起來，簡直就是一場噩夢！
第一步：下載數據——下載速度堪比蝸牛爬行
首先，你需要從Decode網站下載冰島人的pQTL數據。這數據量之大，簡直可以用「海量」來形容。我下載了半天，下載速度堪比蝸牛爬行，一度懷疑人生。下載好後，我的硬碟空間已經告急，仿佛隨時要罷工。
第二步：提取cis-pQTL數據——電腦配置不夠，只能望洋興嘆
接下來，你需要提取cis-pQTL數據。 這可不是簡單的復制貼上，需要強大的編程能力和頂配電腦。 我的普通膝上型電腦瞬間就卡成PPT，CPU風扇呼呼作響，仿佛在向我發出最後的哀嚎。我不得不求助於我的「土豪」朋友，借用他的Mac Studio（此處應有羨慕嫉妒恨的表情）。
第三步：數據過濾——比西天取經還難
數據提取完成之後，還需要進行過濾。 這就像是在沙子裏找金子，需要極大的耐心和技巧。 篩選強相關的SNP，剔除連鎖不平衡……這些步驟都需要大量的編程知識和經驗。我感覺自己仿佛在進行一場馬拉松，而且還是那種全程負重越野跑。
第四步：孟德爾隨機化分析和共定位分析——程式碼跑起來像火箭發射
數據過濾完成之後，終於可以開始數據分析了。孟德爾隨機化分析和共定位分析，聽起來就很高深莫測。 執行程式碼的時候，我的電腦就像火箭發射一樣，CPU占用率飆升，風扇狂轉，感覺隨時可能爆炸。
第五步：靶點基因驗證和單細胞分析——編程能力就是我的生存技能
最後，還需要對靶點基因進行驗證和單細胞分析。這又需要大量的編程知識和生物資訊學技能。我感覺自己就像一個在程式碼海洋裏掙紮的小船，隨時可能被巨浪吞噬。
最終結果：我的錢包和頭發都空了
經過幾天的奮戰，我終於完成了這篇論文的復現。 然而，我的錢包和頭發都空了。這篇文章的復現過程，不僅需要強大的電腦配置，還需要高超的編程能力和紮實的生物資訊學知識。對於像我這樣的「小白」來說，簡直就是一場巨大的挑戰。
我的建議：
如果你想復現這篇論文，請務必做好以下準備：
一台頂配電腦（至少5T硬碟）
：你的電腦配置決定了你的復現速度和成功率。
紮實的編程能力
：你需要熟練掌握R或Python等程式語言。
充足的時間
：這可不是一兩天就能完成的任務。
一顆強大的心臟
：準備迎接各種挑戰和挫折。
當然，如果你不想經歷這些痛苦，也可以選擇使用別人處理好的數據和程式碼流程。 畢竟，時間就是金錢，我的頭發也經不起折騰啊！
最後，我想說，科研之路漫漫，且行且珍惜！希望我的經歷能夠給各位科研工作者帶來一些啟示。也歡迎大家分享你們的復現經驗，讓我們一起在科研的道路上披荊斬棘，勇往直前！
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