過濾系統作為水族箱重要的組成部份，它不但可以作為硝化細菌的載體，還能擔負起水質清潔的作用，如此重要的器材，它的配置也是重中之重，對於喜好diy的魚友配置方案更是一大考驗，下文筆者將針對不同環節的配置進行詳細的講解。
一、過濾形式
過濾系統的形式多樣，如上部周轉箱、上部滴流盒、掛濾，側濾，底濾、濾桶等，diy愛好者大多數會選擇周轉箱，因其價格適中、設計簡便的特點，所以成了眾多魚友們的選擇。
二、水泵配置
水泵的選擇也是需要綜合考慮多個因素，如水族箱水體容量，管道曲折長度造成的流量衰減，濾棉的鋪設面積，每小時流量、楊程功率等。
流量：筆者以80型魚缸為例，尺寸為800*400*400mm，水體容積為128升，按每小時10次水迴圈，另考慮後期流量衰減問題，筆者建議水泵按水體容積每小時15次水迴圈，即128*15=1920升每小時。
楊程：也是重要參數之一，它是指水泵能夠將水擡升的高度，擡升越高，流量衰減越嚴重，其揚程還受到管道的長度、內壁摩擦，套接、曲折程度等的影響，因此選購水泵，需根據實際的高度大1.5-2倍。
功率：功率影響的是楊程、水流量以及耗電量，我們在選購水泵時，只要功率無異常的情況下可不必過多考慮。
三、管道大小
管道的選擇需要考慮魚缸水體大小、水泵流量等情況，管道太小無法滿足魚缸水體迴圈，同時也影響水泵水流經過，較大的管徑雖能滿足水流迴圈，但影響造價及整體協調性。
大多數上濾魚缸管道布置多為20、25、32管徑，筆者建議40型及以下魚缸使用20管徑，60型魚缸選用25管徑，80及以上可用32管徑，或采取雙20、雙25管徑等出水管的選擇，鑒於篇幅有限，本文就不再詳細展開講解，魚友們可查閱我的另一篇關於管道配置的文章。
四、生物倉配置
生物倉濾棉的布置是關鍵步驟，其作用為攔截魚缸排出的雜質，一般采取多層布置，由疏到密分層擺放，濾棉層次越多攔截效果更好，因多層結構可以增加攔截的機會，然而濾棉的布置也要結合魚缸實際需求及生物倉大小進行配置，不可無的放矢，過少影響過濾雜質的效果，太多可能阻礙水流透過。
濾棉除了擺放層次外，表面積大小也是影響過濾效果的重要因素，較大的表面積意味著可以容納更多的雜質，增加過濾效果的同時也可以減少洗濾棉的次數。總之，平面面積建議按魚缸表面積的五分之一為佳，具體魚友們還需綜合考慮魚缸大小及生物倉尺寸進行配置。
五、生化倉配置
濾材作為培養硝化細菌的載體，其表面積為可為硝化細菌及其他微生物附著生長，它起到改善水質、穩定ph值的作用，比如珊瑚骨為堿性材質，能有效提高ph值，再比如活性炭即可以吸收離子又能釋放離子，從而維持ph值的穩定。
濾材的數量一般占水體的10～20%，宜多不宜少，數量越多水質更穩定，即使大量換水硝化系統的容錯率也更高，當然，數量也要在合理範圍內，數量太多亦會增大容器的空間，即與魚缸比例不協調又侵占居室空間。
魚缸過濾系統是水質健康的核心配置，透過合理的搭配可以實作水質的高效凈化，穩定高效的過濾系統可以為魚類及植物提供一個穩定的居住環境，同時可以促進它們的健康生長和繁殖。
