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單位投資者轉讓北交所上市公司限售股與流通股都要按「金融商品轉讓」繳納增值稅。自然人股東則免征增值稅.
上市公司限售股和新三板掛牌公司原始股分紅適用不同稅收政策。根據【財政部 國家稅務總局 證監會關於實施上市公司股息紅利差別化個人所得稅政策有關問題的通知】（財稅【2012】85號），對個人持有的上市公司限售股，解禁前取得的股息紅利，暫減按50%計入應納稅所得額，適用20%的稅率計征個人所得稅政策。而新三板掛牌公司沒有類似規定，原始股分紅可以直接適用差別化個人所得稅政策。北交所企業雖然是上市公司，但在個人所得稅方面明確按照新三板政策執行。
