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完整性高達99.3%!中國科研團隊成功構建

2024-05-07科技

科技日報記者 馬愛平

記者6日從中國農業科學院獲悉,該院深圳農業基因組研究所農業生物轉錄組與代謝組創新團隊發表了首個人參端粒到端粒完整基因組,解析了人參重要活性成分——三萜皂苷的形成機制。相關研究成果日前發表於國際期刊【園藝研究】上。

圖片來源:中國農業科學院深圳農業基因組研究所

論文通訊作者、中國農業科學院深圳農業基因組研究所研究員李偉告訴記者,人參屬於遺傳背景極其復雜的異源四倍體。研究團隊綜合套用多種測序技術,成功構建了完整性高達99.3%的人參全基因組,其大小為3.45Gb。此外,研究人員還精確鑒定了48個端粒,並預測了24個著絲粒,這一成果顯著提高了人參基因組的連續性、完整性和精確度。

基於已構建的高完整性人參基因組,研究人員對人參三萜皂苷合成基因在異源四倍體形成過程中的不平衡前進演化進行了深入探索。研究發現,串聯重復和近端重復在人參三萜皂苷的生物合成過程中扮演了至關重要的角色。同時,研究還發現,在人參中有一個亞基因組的基因比另一個亞基因組的基因更為活躍,存在亞基因組優勢現象。

「該研究為人參的遺傳研究、育種規劃以及人參三萜皂苷的生物合成路徑提供了資源。此外,還為篩選優質人參種質資源以及三萜皂苷的生物合成奠定了理論基礎。」李偉說。

編輯:劉義陽 張琦琪

稽核:朱麗