在数码宝贝世界中出现了很多强大的数码兽，比如可以格式化世界树的奥米加兽X，被称为数码之神的须佐之男兽，可以进化到超究极体的阿卡迪兽等，这些无论多强大，都只能是数码兽，然而数码世界中却有一些存在，并非数码兽，而是数码世界的最高意志，现就对出现的这些最高意志做一个盘点。
一、世界树
世界树是数码世界的主机，是真正的主宰者，立于网络安全最高位的数码世界真神，世界树手下皇家骑士团负责执行世界树的命令，清除对数码世界有威胁的存在，但是动画中世界树的表现基本上都是攻击性很强的反派。
世界树手下的皇家骑士团在执行世界树命令时出现分歧，经常发生内斗，也被称为内斗团，在剧场版【数码宝贝：第十三位皇家骑士】中世界树执行方舟计划，想要放弃现有的数码世界，最终被奥米加兽X以一招「全部删除」，将其击败。
在第五部中，世界树再次出现，想要对引发数码世界危机的人类进行清除命令，手下的皇家骑士团对这一指令并不认可，接连跳反对抗世界树，最终与主角们合力将其击败。
二、恒常性
恒常性同样是数码世界的主机，不过与世界树不同，恒常性没有出现过本体，大都通过神婆嘉儿传达意志，被选召的孩子便是因为恒常性才出现的，恒常性创造了神圣计划，同为数码世界的最高意志，恒常性比较温和，也更加理性。
在数码宝贝tri中，代表世界树的阿尔法兽想要清除缅因猫兽，代表恒常性的杰斯兽前来阻止，于是便出现了四方混战的名场面。
三、荷马
皇家骑士团是执行世界树命令的最强团队，同样也有一个组织与皇家骑士团齐名，以奥林匹斯12主神为原型设计的「奥林匹斯十二神族」，十二神族背后的掌控者是「荷马」系统。
四、NEO
NEO被称为世界树的未来形态，是七大魔王巴尔巴兽人为创造出的数码兽， 它的存在可以说是基于世界树进行创造的，实力要比世界树更为恐怖，NEO出场于漫画【数码兽次世代】中，在被胜利暴龙兽这位调停者的嘴遁攻击下，选择自我消失。
五、帝厉魔
帝厉魔出自第三部作品中，是最终BOSS，它的存在更像是数码世界的杀毒程序，为了排除异己，一度想要将数码世界毁灭，在与主角团对战中，也只是被打退化，并未彻底消灭。
这里初代与二代的数码兽世界观是共同的，所以世界树与恒常性一个是老主机，一个是新主机，二者并存，其他的更像是平行世界中的系统神。
